与IBD相关的宿主 - 微生物相互作用相关的基因

作者:吕摔

<p>研究人员已经确定了超过70种新的遗传风险因素(显示为染色体上的亮点,蓝色阴影)与炎症性肠病(IBD)相关图片由Janet Iwasa和Bang Wong提供新发表的一项研究确定了另外71种IBD遗传关联表明IBD易感基因与免疫系统对分枝杆菌感染有关的基因之间存在强烈的重叠,包括结核病和麻风病克罗恩病(CD)和溃疡性结肠炎(UC) - 胃肠道炎症性疾病 - 几十年来困扰着科学界十年前,研究人员认识到基因和环境都对这些疾病有所贡献,但对疾病的发生方式和原因几乎一无所知今天,来自CD和UC社区的研究人员聚集在一起分享原始数据以及新收集的遗传信息</p><p>剖析影响数百万人的一系列条件的生物学世界范围他们的研究集中于两种疾病,统称为炎症性肠病(IBD),并提出IBD风险与参与其他免疫相关疾病的基因和免疫系统对病原体的反应之间的基本联系</p><p>来自哈佛大学和麻省理工学院,哈佛大学附属马萨诸塞州综合医院(MGH),耶鲁大学医学院,Cedars-Sinai医学中心和其他几十个组织的研究人员本周出现在一篇自然报纸上“这项研究首次出现我们已经从世界各地的许多研究中获取并合并了原始数据,也是我们第一次共同分析克罗恩病与溃疡性结肠炎,“该工作的高级作者之一,高级助理成员马克戴利说</p><p> Broad研究所及其医学和人口遗传学项目的联合主任Daly也是MGH分析和转化遗传学部门的负责人和协会哈佛医学院(HMS)教授“我们已经能够通过这项研究同时评估这两种疾病的证据,并发现大多数遗传风险因素都与这两种疾病有关”“已经出现了范式转变我们对IBD的理解这个基因发现过程提供了一个机会,可以开始确定新的治疗目标,更好的诊断工具,并从长远来看,为患者提供个性化护理,“共同作者HMS医学副教授Ramnik Xavier说道</p><p> Broad研究所的高级准会员,胃肠病学主任和MGH炎症性肠病研究中心主任“我们现在有了必要的起始材料来了解导致克罗恩病和溃疡性结肠炎的途径,我们也有一个框架,以更好地了解它们可能不是两种不同的疾病,而是许多不同疾病的集合“克罗恩迪sease和溃疡性结肠炎有许多共同之处:两者都会导致许多相同的胃肠道症状,并且两者的特点是身体的免疫系统对无害细胞或细菌的反应不当过去10年来,研究人员进行了全基因组关联研究,数千名患有CD或UC的患者的基因组,并将他们与没有这些疾病的人的基因组进行比较,以发现显着的遗传差异</p><p>这项新研究不仅汇集了之前分析的原始数据,还增加了遗传信息</p><p>另外40,000人有或没有IBD形式“如果我们想获得更多的命中,但也要分析克罗恩病和溃疡性结肠炎之间的差异或了解共性,我们真的需要分享我们所有的基因数据,”第一作者Stephan Ripke,Broad研究所的研究员和MGH Ripke与共同第一作者Luke Jostins密切合作</p><p>桑格研究所结合并分析了来自许多不同机构的研究人员收集的遗传信息</p><p>这项新研究确定了71种额外的IBD遗传关联,其中许多先前已涉及其他免疫相关疾病,包括强直性脊柱炎和牛皮癣新研究也表明IBD易感基因与免疫系统对分枝杆菌感染(包括肺结核和麻风病)反应相关的基因之间存在强烈重叠 研究人员已经观察到CD中的免疫应答与结核病中的免疫应答之间的相似性,并且他们假设CD可能是对肠道中存在的某些无害生物的异常反应,引发类似的反应除了利用先前研究的原始数据,该工作采用了一种相对较新的工具,称为免疫芯片,可以对以前与自身免疫和炎症疾病相关的基因组中的200,000个位点进行采样“作为一个研究领域,我们设计了这个阵列来靶向涉及免疫介导的各种疾病的基因,” Daly说:“这是我们首次使用免疫芯片的研究之一,这些研究中将会有更多的结果 - 在IBD和跨越免疫疾病中”在Broad研究所,研究人员已经开始研究以前发现的一些途径</p><p> UC和CD的研究,包括自噬,感染细胞自食以对抗微生物的过程“这项工作g让我们有更多的追求,“Xavier说道</p><p>”它为我们提供了高质量的转化研究的机会,使我们能够识别IBD中涉及的核心途径,更好地了解基因如何相互作用以及如何与环境相互作用,照亮新的途径导致疾病的原因“来源:Haley Bridger,Broad Institute Communications; Harvard Gazette图片:....